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Microarray Analytik Microarrays können verwendet werden, um genomweite Expressionsprofile zu erstellen. Die aus Gewebeschnitten (z.B. Tumoren) isolierte RNA wird auf einem Array analysiert, dabei können die Signale Hinweise auf regulierte Gene geben, die eine Rolle bei einem Krankheitsprozess spielen. Wir verwenden sowohl high-density-arrays der Firma Affymetrix als auch low-density-arrays der Firma eppendorf.
Microarray Analytik - Vorgehen Die Microarray Analytik setzt ein hohes Maß an Standardisierung und eine präzise Kontrolle der Einflussgrößen voraus. Aus diesem Grund bieten wir Unterstützung bei dem Experiment-Design und der Präanalytik an. Der Anwender wird mit entsprechenden SOPs ausgestattet und auf jeder Ebene der Analytik werden entsprechende Qualitätskontrollen durchgeführt. Für die Beurteilung der RNA-Qualität empfehlen wir die LabChip-Analytik (Agilent Bioanalyzer) oder die Verwendung von Test-Arrays. Microarray Analytik – Data mining Die folgenden Programme stehen Anwendern zur Verfügung: Microarray Suite, MAS, GeneChip Operating System, GCOS (Server), MS-SQL, Data Mining Tool, DMT, MS-Access, MS-Excel, NetAffx, R, D-Chip, GenMAPP, Diverse Internet Databanken. Die Daten können per FTP, DVD, CD-ROM oder ZIP-Disc zur Verfügung gestellt werden. Das Datamining selbst wird nicht als Service angeboten. Unterstützung ist möglich.
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